创新服务旨在衡量政府为促进科技创新而发挥的服务及引导作用。创新服务下设4个二级指标，包括科技条件、技术市场、创业孵化和金融服务等，具体细化为12个三级指标，共占总指标权重的20%。
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创新资源是一个地区持续开展创新活动的基本保障，反映了全社会对创新的投入，创新人才资源的储备状况以及创新资源配置结构。创新资源下设创新人才和研发经费两个二级指标，具体细化为20个三级指标，共占总指标权重的20%。
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创新环境主要反映创新活动所依赖的外部软件环境和硬件环境，为科技进步与创新提供保障。创新环境下设政策环境、人文环境、生活环境和国际交流四个二级指标，具体细化为14个三级指标，共占总指标权重的20%。
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